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實(shí)例應(yīng)用-如何計(jì)算DNA片段中的分子數(shù)?

作者: 蘇州阿爾法 編輯: 阿爾法生物 來(lái)源: 蘇州阿爾法生物 發(fā)布日期: 2021.12.08
信息摘要:
在定量PCR實(shí)驗(yàn)中,常常會(huì)遇到計(jì)算 DNA 片段中的分子、計(jì)算溶液的濃度或計(jì)算連續(xù)稀釋等,這樣的計(jì)算有沒(méi)有什么好的方法呢?

實(shí)驗(yàn)室數(shù)學(xué)在生物學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析中一直是一個(gè)令人頭疼的問(wèn)題?在定量PCR實(shí)驗(yàn)中,常常會(huì)遇到計(jì)算 DNA 片段中的分子、計(jì)算溶液的濃度或計(jì)算連續(xù)稀釋等,這樣的計(jì)算有沒(méi)有什么好的方法呢?

當(dāng)然有了,在本文中,我們將教你簡(jiǎn)單的 DNA 樣本中的分子計(jì)數(shù)法。

——例如,套入公式即可一招輕松拆解:500 ng 樣本中有多少個(gè) 50 堿基對(duì) (bp) 片段的模板 /副本?這樣的棘手問(wèn)題。使您很快就會(huì)成為實(shí)驗(yàn)室中的計(jì)算高手!

一、計(jì)算 DNA片段中分子數(shù)量的應(yīng)用

在進(jìn)行以下類(lèi)型的實(shí)驗(yàn)時(shí),通常需要DNA分子的計(jì)算

DNA 連接

生化分析。

實(shí)時(shí) PCR(絕對(duì)定量)。

測(cè)量載體基因組的數(shù)量。

二、分子數(shù)計(jì)算公式的原理

我們知道,單個(gè) DNA bp 的平均重量為 650 道爾頓。這也可以寫(xiě)為 650 g/mol= 摩爾質(zhì)量)。因此,任何雙鏈 DNA 片段的分子量或摩爾質(zhì)量都可以通過(guò)將其長(zhǎng)度(以 bp 為單位)乘以 650來(lái)計(jì)算,答案將表示為道爾頓或 g/mol。

只要我們知道序列長(zhǎng)度(即基因組的長(zhǎng)度/大?。?,此計(jì)算將適用于任何物種的基因組 DNA。

三、實(shí)例與應(yīng)用:

1.實(shí)例問(wèn)題: 5.2-kb 質(zhì)粒的分子量是多少?記住 5.2 kb = 5200 bp

計(jì)算: 5200 bp x 650 道爾頓 = 3,380,000 道爾頓或 g/mol

現(xiàn)在我們知道如何計(jì)算 DNA 模板的分子量了。使用阿伏伽德羅數(shù),即 6.022 x 10 23分子/摩爾,可以使用以下公式計(jì)算每模板的分子數(shù):

計(jì)數(shù)

2.實(shí)例問(wèn)題:您有 300 ng 5.2-kb 質(zhì)粒。你的質(zhì)粒有多少拷貝?

分?jǐn)?shù) 

 

3.實(shí)例問(wèn)題:您有 50 ng 20-bp 引物。你的引物有多少份?

引物份數(shù)

4.實(shí)例問(wèn)題:您有 150 ng 670 bp 純化 PCR 產(chǎn)物,你有多少份 PCR 產(chǎn)物?

 

注意:此公式基于您使用的是單一 DNA 物種的假設(shè),因此在應(yīng)用于 PCR 產(chǎn)物或質(zhì)粒時(shí),請(qǐng)確保您只有 1 個(gè)條帶或您有干凈的質(zhì)粒小量制備。

所以實(shí)驗(yàn)中,只要知道 DNA 片段的長(zhǎng)度和以納克為單位的濃度,您就可以輕松應(yīng)用該公式來(lái)獲得任何類(lèi)型的 DNA 樣本中的拷貝數(shù)。

四、其他分子量計(jì)算常用的公式

分子量計(jì)算

DNA分子量計(jì)算

如果您有關(guān)于DNA片段計(jì)數(shù) 、PCR實(shí)驗(yàn)等相關(guān)問(wèn)題,請(qǐng)0512-62956104與我們聯(lián)系。



蘇州阿爾法生物實(shí)驗(yàn)器材有限公司成立于2008年,位于蘇州園區(qū)生物納米園(Biobay)A5幢301室。公司管理團(tuán)隊(duì)專(zhuān)注于科學(xué)儀器行業(yè)十四年,擁有專(zhuān)業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)與完善的售后服務(wù)體系,目前已為300余家實(shí)驗(yàn)室提供優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品和服務(wù),涵蓋各大高校、檢測(cè)中心、科研機(jī)構(gòu)、制藥企業(yè)等13個(gè)群體。提供的實(shí)驗(yàn)室儀器主要包括振蕩培養(yǎng)箱,恒溫恒濕培養(yǎng)箱、二氧化碳培養(yǎng)箱、生化培養(yǎng)箱、霉菌培養(yǎng)箱、PCR儀,瑞寧移液器,生物反應(yīng)器,發(fā)酵罐,超低溫冰箱,液氮罐,高壓滅菌器,超純水機(jī),天平,離心機(jī),離心濃縮儀、研磨機(jī)、葡萄糖乳酸分析儀等。廠商企業(yè)授權(quán)包括知楚儀器、朗基、中科美菱,梅特勒,樂(lè)楓,搏旅、NEST、天根、奧盛在內(nèi)的80個(gè)余廠家。

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